塞浦路斯王国（13世纪到14世纪）
塞浦路斯王国为中世纪晚期建立于塞浦路斯岛上的一个十字军国家，存续韶光为1192–1489。其统治者是法国的吕西尼昂家族。1191年，英格兰国王理查一世攫取了拜占庭帝国治下的塞浦路斯。之后，理查一世将塞浦路斯卖给了圣殿骑士团。圣殿骑士团将塞浦路斯又转卖给了耶路撒冷国王吕西尼昂的居伊。1192年，居伊建立了塞浦路斯王国。
塞浦路斯王国（15世纪）
威尼斯共和国（1489-1571）
1489年，威尼斯王国末了一个皇后凯瑟琳尔纳罗，被迫将塞浦路斯岛卖给威尼斯共和国，开始被威尼斯共和国统治，直到1571年被奥斯曼帝国盘踞。
奥斯曼帝国（1571-1881）
英属塞浦路斯（1881-1922）
1878年巴尔干危急期间，塞浦路斯岛被英国盘踞。之后在柏林会议的个中一项颠末议定，英国从奥斯曼帝国手中接管塞浦路斯政府。这也是英国统治塞浦路斯的开始。1914年第一次天下大战刚开始不久，英国合并了塞浦路斯。
英属塞浦路斯（1922-1960）
塞浦路斯共和国（1960-1960）
1960年4月，塞浦路斯从英国独立之后，开始启用自己的国旗。最初塞浦路斯国旗上的塞浦路斯国土图案为橙色轮廓.
塞浦路斯共和国（1960-2006）
1960年8月把塞浦路斯国土图案添补为橙色，比例为3:5。
塞浦路斯共和国（2006至今）
2006年，对原设计进行了修正，变动了舆图和橄榄枝的设计及色彩，图案与原设计比较轻微放大，并将比例改为2:3。国旗由铜色塞浦路斯岛地形图、橄榄枝和白色的背景组成的旗帜。白色旗底象征和平，铜色代表该国的紧张矿产——铜矿，舆图代表塞浦路斯，两支绿色橄榄枝分别代表希腊人和土耳其人，也代表了塞浦路斯两个民族神往和平。塞浦路斯国旗常日会与希腊国旗和欧盟旗帜一起悬挂。
塞浦路斯教会旗帜
塞浦路斯殖民地高等专员旗帜（1881–1905）
塞浦路斯殖民地民用旗帜（1922–1960）
塞浦路斯殖民地总督旗帜（1905–1960）
安南发起办理塞浦路斯问题利用的塞浦路斯联邦共和国国旗
塞浦路斯土耳其族邦（1974年-1983年）
北塞浦路斯土耳其共和国（1983年-1984年）
北塞浦路斯土耳其共和国（1984年至今）
1983年，塞浦路斯北部的土耳其人独立建国为“北塞浦路斯土耳其共和国”，塞浦路斯开始分裂，北塞浦路斯重新努力别辟门户设计了一壁与土耳其国旗相似的北塞浦路斯国旗。塞浦路斯国旗只有南部的希腊人利用。实际上大多数时候土耳其人利用的是北塞浦路斯国旗和土耳其国旗， 希腊人利用塞浦路斯国旗和希腊国旗。